網箱飼養黃顙魚的日常管理有網箱檢查、魚體生長檢查、網箱箱體清洗及病害防治等內容。
（一)常規檢查
常規檢查有網箱箱體檢查和箱內魚體生長檢查等。
1.網箱箱體檢查 網箱箱體檢查有放魚種前後的檢查和飼養過程中的檢查，這兩種檢查都非常重要。魚种放養后，每天早晚各檢查箱體1次，看網衣是否有破損情況。檢查的方法是將網箱的四角依次慢慢提起，仔細察看網衣是否破損，網目是否被水老鼠等咬破，是否被背、胸刺刺破，在操作中是否損壞箱體等。發現問題，及時修補。為防止破網逃魚，一般採用雙層網箱的形式，檢查時，先檢查內層網箱，再檢查外層網箱。
2.箱內魚體生長檢查 由於網箱養殖黃顙魚要分級飼養，而分級飼養的重要依據是魚體生長是否到一定階段。只有通過定期檢查魚體，才能掌握魚類的生長情況，不僅為投飼提供了實際依據，也為產量估計提供了可靠的資料。生長檢查一般要求前期每5～7天、後期每半個月檢查1次，分析存在的問題，及時採取相應的措施。檢查魚體生長情況的方法一般是用抄網從網箱中撈起箱內的黃顙魚，放入小盆、小桶中，再用尺子對魚體進行測量。同時要觀察魚的肥滿度，以及時調整餵養。
(二)箱體污物的清洗
一般來說，網箱下水后的3～5天，就會附著大量污物，以後又會附上水綿、雙星藻和轉板藻類等著生藻類(亦稱附著藻類)，堵塞網目，從而影響網箱內外水體的交換，不利於黃顙魚的養殖。這種情況下必須進行人工清除，目前國內在網箱養魚中清洗網衣有以下幾種方法：
1.人工清洗 網箱上的附著物比較少的時候，可先用手將網衣提起，然後抖落污物，或直接將網衣浸入水中刷洗。當附著物過多時，可用硬刷刷洗，或直接將網衣浸入水中用竹片拍打，使其抖落。操作要細心，防止傷魚、破網。
2.機械清洗 在網箱規模較大時，可使噴水槍、潛水泵，以強大的水流將網衣上的污物沖落。
3.沉箱法 各種絲狀綠藻一般在水深1米以下處就難以生長和繁殖。因此，將封閉式網箱下沉到水面以下1米處，就可以減少網衣上附著物的附生。但此法往往會影響到投餌和管理，對魚的生長不利，所以使用此法要因地制宜，權衡利弊后再作決定。
4.生物清污法 利用鯝魚(如細鱗斜頜鯝、黃尾鯝)等魚類喜刮食附生藻類、吞食絲狀藻類及有機碎屑的習性，在網箱內適當投放黃尾鯝、細鱗斜頜鯝等魚類，讓它們刮食網箱上附著的生物，一使網衣保持清潔，水流暢通。利用這種生物清污物，既能充分利用網箱內餌料生物，又能增加養殖種類，提高魚產量和經濟效益。
(三)災害天氣的管理與做好日誌記錄
1.災害天氣管理 災害天氣主要指大風、暴雨和洪水。大風常伴隨暴雨出現，設置在湖泊、大水域內的網箱，有時會使網箱傾翻或被風浪淹沒，所以在刮大風前必須檢查網箱的框架和支柱是否牢固。固定式網箱要加固繩索，並適當提高網箱露出水面部分的高度。浮式網箱要防止大風期間網箱底部挨著湖底，以防因摩擦而引起斷線和破網。洪水可以使網箱設置區的水流加速，沖致使網箱固定樁和使浮式網箱走錨移位，水位升高可使固定式網箱沒頂逃魚，必要時將開口式網箱加蓋封頂。無論大風還是暴雨或者洪水，在過後要立即檢查，一旦發現問題，立即修復和搶救。
2.記好飼養日誌 養殖日誌是檢查工作、積累經驗、制定計劃和提高技術的重要參考資料。實行科學養魚，一定要記好每口網箱的日誌，這是最基本的管理工作。網箱日誌應包括日期、天氣、水溫、放養、捕魚記錄、魚體成長度記錄，投飼種類及數量、魚類活動情況及防治魚病措施等項目。根據日誌分析問題、總結經驗教訓，是順利開展網箱養殖黃顙魚的重要環節。
